1、建设工程结算纠纷的原因有：建设工程招投标程序中的违法行为；招投标程序中的串标、泄露标底的行为；缺乏有效的诚信机制；法制缺陷留下造成逃废工程款的漏洞。
2、法律依据《民法典》
第五百七十九条 当事人一方未支付价款、报酬、租金、利息，或者不履行其他金钱债务的，对方可以请求其支付。
第八百零七条 发包人未按照约定支付价款的，承包人可以催告发包人在合理期限内支付价款。发包人逾期不支付的，除根据建设工程的性质不宜折价、拍卖外，承包人可以与发包人协议将该工程折价，也可以请求人民法院将该工程依法拍卖。建设工程的价款就该工程折价或者拍卖的价款优先受偿。