检察院批捕后的程序为：先由公安机关继续侦查，侦查终结后将案件移送检察院，由检察院审查起诉，对于符合起诉条件的案件，由检察院代表国家向法院提起公诉并将案卷材料移送至法院，最后由法院审理并宣判。