处理土地权属纠纷的程序是：
1、协商。因土地使用权发生纠纷的双方当事人可以通过协商解决；
2、调解。当事人可以通过调解解决纠纷；
3、仲裁。当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的可以向辖区仲裁机构申请仲裁；
4、诉讼。根据纠纷内容直接向人民法院提起诉讼。
土地纠纷最佳解决方法是这样的解决农村土地纠纷的原则应当是多管齐下。完善的纠纷解决机制是农村土地纠纷解决的有效途径和手段。