离婚协议中明确说明到相关部门办理过户。在协议离婚时，首先要明确房产将过户到谁的名下归谁所有，然后到房地产管理部门办理过户。如果在协议离婚中明确说明归女方所有，但离过婚后对方不配合，就能通过起诉将房产过户到名下，为了避免离婚后出现一方不配合的状况，可以在办理离婚的时候，将离婚协议书进行公证，证明协议的真实性，这样房管局就会对离婚协议进行认可，将房产过户。若认为公证依旧不安全，可以用协议书或者直接到法院起诉调解的方式结案，拿到法院的调解书与办理离婚协议书公证一样的效力。