巴氏杀菌的牛奶可以在微波炉中加热，但需要注意一些事项：

1. 首先将牛奶倒进微波炉的容器中，并用保鲜膜或盖子盖好。

2. 将微波炉功率调到中等或低档。高功率加热会使牛奶变得很热，容易烫伤，并且可能导致牛奶在容器中溢出。

3. 每隔30秒左右，取出牛奶容器，用勺子搅拌一下，以避免牛奶热成块。

4. 当牛奶温度达到所需温度时，将其取出即可。

需要注意的是，巴氏杀菌的牛奶经过高温处理，使得其中的营养成分大幅降低，加热后还会进一步降低。因此，最好使用低温短时间的加热方式，以保留牛奶的营养成分。同时，加热后的牛奶应立即饮用或冷却保存，避免滞留时间过长导致微生物滋生。