在Unity中保存项目的方式有以下几种：

1. 自动保存： Unity会每隔一段时间自动保存项目。可以在 Edit → Preferences → Auto-save interval 中选择保存时间间隔。

2. 手动保存：可以通过点击菜单栏上的 File → Save Project 或 File → Save Scene 来手动保存项目或场景。

3. 快捷键保存：可以使用快捷键 Ctrl + S 来保存当前场景或项目。

注意事项：

1. 只有在Assets文件夹中的资源才会被保存。如果修改了其他文件夹中的资源，需要先把修改后的资源拖到Assets中再进行保存。

2. Unity会自动创建.meta文件来记录每个资源的元数据。保存时需要确保.meta文件也同步保存。