1、核磁共振主要用于中枢神经系统疾病、关节及其周围软组织疾病、血管畸形等的检查。具体疾病如脑梗塞，脑出血，以及颅内的占位性病变，脊髓炎，脊髓占位以及脊髓血管畸形等疾病。

2、在检查关节软组织如椎间盘、韧带、半月板疾病方面具有良好的分辨率。但是在检查空腔脏器如胃肠道，以及含气体较多的组织如肺部病变时，是不宜选择的。