分公司签订的转让合同是否有效要看合同的签订主体是否有效。并不是所有的分公司都可以签订合同，只有有营业执照的分公司才可以是对外以自己的名义签订合同，成为民事诉讼当事人。如果分公司无权签订合同，则未经总公司同意或者授权，擅自转让合同是无效的。