一、商标格式合同不备案的后果

商标格式合同主要是保护经营者的合法利益，备案的合同会受到法律保护，没有备案的合同会对其进行罚款。

根据《商标法》规定，如不备案，许可人或者被许可人所在地工商行政管理机关将责令限期改正;拒不改正的，处以一万元以下的罚款，直至报请商标局撤销该注册商标。许可他人使用其注册商标的，许可人应当将其商标使用许可报商标局备案，由商标局公告。商标使用许可未经备案不得对抗善意第三人。

二、商标使用许可合同是否必须备案

根据《商标法》规定，商标许可人应当在签订商标使用许可合同之日起三个月内，将以下文件报送商标局备案：

(1)由许可人和被许可人共同签署的《商标使用许可合同》原件;

(2)由许可人和被许可人共同签署的《商标许可合同备案表》;

(3)《商标注册证》复印件;

(4)被许可人的《营业执照》或副本复印件

三、商标许可备案怎么办理

1、委托商标代理机构办理商标使用许可合同备案的，申请人可以自愿选择任何一家国家认可的商标代理机构办理。所有在商标局备案的商标代理机构都公布在“代理机构”一栏中。

2、申请人直接到商标注册大厅办理商标注册申请的，申请人可以按照以下步骤办理：

(1)准备申请书件

(2)在商标注册大厅受理窗口提交申请书件

(3)在打码窗口打收文条形码

(4)在交费窗口缴纳备案规费

(5)收取商标使用许可合同备案通知书

(5)收取商标使用许可合同备案通知书

商标格式合同备案主要是保护经营者的合法利益，随着社会上企业发展越来越壮大，需要监管的力量也就越来越强大，所以经营者一定要严格遵守法律的规章制度，一旦查到没有按规章制度运营的，会先对其警告，屡教不改，则可以对其罚款。