纳氏彩龟与巴西彩龟极为相似，非但不是同种，而且也不同属。相比起来，成体后，纳氏彩龟的头较小，吻亦比较钝。幼体不呈绿色，常为黑褐色的底色上有明亮的黄色斑纹，色彩反差剧烈，异常艳丽。头顶部有一鲜黄色箭头形斑纹，跟后无巴西彩龟的红色斑块，而是每侧具两条浅黄色或黄白色的较宽条纹，斜向后下方延伸。其余部分几乎与巴西彩龟一样，只是条纹较粗，且鲜明，与底色反差强烈。

纳氏彩龟四肢黑灰色，前肢具鲜明黄色条纹，后肢斑纹不清晰。尾巴较短小，亦有丫形花纹。四肢具丰富的蹼。背甲具一脊棱，底色褐色，具旋涡状的斑纹，旋涡间的空隙黄色，形成鲜明的花色斑纹。腹甲黄色至橘红色，有少许实心黑斑，甲桥处通常无斑，缘质下方有环形黑斑。幼体甚为艳丽，但长大后，背甲颜色变黑，斑纹亦开始模糊不清，黄色纹转为红褐色，腹甲红色渐淡，但仍可辨出，而且与食物似有关联，身体软组织部分斑纹不变，仍十分漂亮。

纳氏彩龟成体龟较巴西彩龟显得厚实肥满。纳氏彩龟类的喙不如巴西彩龟的壮，其细小的齿，是与其偏植物食性相适应的。另外，常有另两种彩龟：素雅彩龟、佛州彩龟的幼体混于出售的纳氏彩龟之中。前者即是甜甜圈泽龟，与纳氏彩龟相比，身上各处斑纹都很细密，黄色也较暗，常显得不够艳丽，腹甲蜡黄色，只在盾片接缝片有斑纹。后者与纳氏彩龟更易混，只是背甲上旋涡更多，旋涡间不形成宽大的黄色条斑。腹甲黄色到黄白色，涡间不形成宽大的黄色条斑。腹甲黄色到黄白色，几乎无斑。两种间甚至可能有杂交的个体。