发酵床的粪便可以用于农业生产和肥料制作。处理方法主要有以下几种：

1. 畜禽粪便堆肥：将发酵床的粪便堆放在室外，与草、秸秆等混合堆肥。通过自然风干，加速腐烂分解，提高肥料的有机质含量和肥效。经过一定时间后，可作为天然的有机肥料，用于种植各种农作物。

2. 生物发酵处理：利用微生物处理粪便，通过生物发酵将有机物质分解成可溶性、易吸收的养分，从而提高部分营养成分的含量，减少臭气的产生。这种处理方法可以提高肥料的品质和养分含量，但需要专业的设备和技术支持。

3. 热压处理：利用热压技术将发酵床的粪便制成固态肥料。通过高温高压的处理，可有效杀灭病菌和病毒，减少臭气的产生。这种处理方法可以大幅度减少粪便的体积和重量，便于储存和运输。但需要耗费一定的能源和成本。

无论采用何种处理方法，都应注意防止环境污染和细菌滋生。可采取相应的措施，如覆盖材料、装置气密容器等，以减少臭气和有害物质的散发和污染。