《海底两万里》的主人公是名叫皮耶尔·阿隆纳克斯（Pierre Aronnax）的法国海洋学家。他是一位既著名又受人尊敬的学者，曾多次参加海上调查活动。在一次被美国政府委派的任务中，他和他的两个同僚——年轻的鲸鱼捕手尼德·兰和熟练的船长弗拉格利（Captain Farragut）一起乘坐“艾孚斯号”的船，在太平洋里寻找一只神秘的海怪。

在追赶海怪的过程中，他们最终被迫登上了一个动力强大、外形奇特的海底潜艇——“鹦鹉螺号”，并在那里和艇长纳摩船长及他的助手们一起度过了数月非凡的冒险旅程。

然而，最令人惊讶的是，“鹦鹉螺号”艇长纳摩船长实际上是个印度王子，他在自己的祖国遭受不幸之后，逃到了海洋深处，并在那里创造了自己的世界。他借助巨大的技术力量建造了“鹦鹉螺号”，并开始了一场不懈的探险之旅，带着他的船员们穿越全球深海。 皮耶尔·阿隆纳克斯最终发现，纳摩船长打算在海底中逃避外面的世界、追求自己的理想。

因此，“海底两万里”的主人公实际上是皮耶尔·阿隆纳克斯，但故事的重心却是纳摩船长和他的冒险旅程。这个故事提供了对科学知识、技术力量、人类文明和探险精神的深刻思考，是法国科学家儒勒·凡尔纳的一部经典科幻小说。