1、河豚的毒素主要集中在卵巢和肝脏，其次是肾脏、血液、眼睛、鳃和皮肤。

2、卵巢含剧毒，为河鲀含毒量最大的强毒部分之一。精巢是微毒或无毒;卵巢与精巢为长圆形，位于腹腔后部，肛门附近。二者在生殖时期，易于辨别，睾丸为乳白色，卵巢为浅黄色;横断切面，精巢呈白乳糜状，而卵巢则呈颗粒状;但秋后因生殖期已过，卵巢与精巢皆呈萎缩，二者间较难辨别。

3、肝脏为河豚一较大纵长的器官，位于腹腔的右侧，上接膨大的胃部，下部尖端达肛门附近，呈灰褐色，内侧具有一绿色的胆囊。肝脏为河鲀剧毒部分，食河鲀时宜特别注意在食前务必剖除干净，人工养殖的可以通过油煎后食用。

4、河豚其毒素的毒量多少，常因季节的不同而有变异。每年2～5月为卵巢发育期，毒性较强;6～7月产卵后，卵巢退化，毒性减弱。肝脏也以春季产卵期毒性最强。所以，每当春末夏初鲜食河鲀鱼时，应特别谨慎，必须选择鲜活鱼体，严格去除内脏，以免中毒。