黑苦荞全株茶和胚芽茶的区别在于原料的部位和制作方法的不同。

黑苦荞全株茶是以黑苦荞的根、茎、叶、花、果实为原料，经过筛选、清洗、晒干等多道工序制作而成的。这种茶叶富含芳香物质和多种营养成分，具有独特的香气和口感。

而胚芽茶则是以黑苦荞的芽为原料，经过精细加工而成的一种茶类。它采摘自黑苦荞的嫩芽，经过摘、揉、晒等过程，使茶芽中的营养物质保留在茶叶中，香气清爽，口感甘甜。

总之，黑苦荞全株茶是以整个苦荞植株制作的茶叶，茶叶种类多，营养成分丰富；胚芽茶则是以苦荞的芽为原料，只有一种茶叶，口感更加清新、甘甜。