据传说，日月潭的名称来源于两位恋人的传说故事。他们分别是日族的少女姥姥和月族的青年阿爵。他们相爱后被阻止，被迫分离。为了继续相见，他们选择从潭上的两座山之间的独木桥相会，每月一次，仿佛日落月出。从此，这个被两山包围的湖泊就被称作日月潭了。

另一种说法是，据南投县地名官网所述，日月潭的名称源自于澳门地方，在珠海区太阳山和月亮山之间有个小湖，名称是日月潭，因为日月潭位于台湾，所以此名被迁往台湾，日月潭成为了台湾著名的景点。