发酵技术的历史可以追溯到数千年前，最早被应用于食品和饮料的生产。在中国，发酵食品的历史可追溯至3000多年前，例如豆腐、酱油、米酒等。古代埃及人和中东人也使用了发酵技术制作酒精饮料。古希腊和罗马人在葡萄酒的生产中也广泛使用发酵技术。

在中世纪，发酵技术得到了更广泛的应用，特别是在奶制品和面包的生产中。在18世纪，发酵技术的理论开始发展，其中最重要的是路易-巴斯德的微生物理论。他证明了发酵是由微生物引起的，并发现了细菌和酵母菌。这使得发酵技术的应用得到更深层次的了解和掌握。

在20世纪，发酵技术得到了广泛的应用，如在生物技术、制药、化妆品、环保等领域。发酵技术的进步和发展仍在继续，人们一直在探索更多的应用领域，以便更好地利用其优势。