发酵床养猪的致命缺点主要有以下几个：

1. 环境污染严重：发酵床养猪会产生大量氨气、硫化氢等有害气体，容易对环境造成污染，对周边居民的生活造成影响。

2. 疾病传播速度快：由于猪只密集饲养、感染疾病的概率较大，如果控制不好，疾病会很快传播开来，且难以管控。

3. 饲养成本高：发酵床养猪需要投入大量人力、物力、财力，比普通饲养方式成本更高，且管理难度较大。

4. 猪只健康问题：由于猪只生长环境不卫生，容易患上疾病，如果不及时治疗，会严重影响猪只的健康和生长发育。

5. 养殖周期长：发酵床养猪方案，由于其饲养方式的复杂性，养殖周期相比常规饲养方式较长，导致经济效益低迷，投资回报较低。